Москва настаивала на ускорении рыночных реформ и демократизации политической жизни в Белоруссии. Минск требовал наделения органов союза правом выносить решения, обязательные для обеих сторон. Кремль не согласился с белорусским вариантом Союзного договора, после чего решение этого вопроса было отложено на три года.
8 декабря 1999 года, накануне парламентских выборов в России, Союзный договор был подписан. Однако по сути это не сдвинуло интеграцию с места. В 2002 году Лукашенко выступил с новой инициативой: Союзным государством президенты могут руководить по очереди.
Российский президент отверг ее и предложил взамен интеграцию по образцу Евросоюза, которая при формировании руководящих органов учитывает экономический вклад и численность населения стран-союзниц.
Но этот вариант пришелся не по душе уже белорусскому лидеру. На этой стадии процесс объединения был заморожен.
